RNAi作为一项最具潜力的治疗手段备受生物技术公司追捧，RNAi相关的专利也是兵家必争之地。全球领先的RNAi公司Alnylam Pharmaceuticals近期就在美国麻省卷入RNAi专利诉讼案中。

　　Alnylam Pharmaceuticals及德国Max Planck科学进步协会（Max Planck隶属于该协会）状告3个机构，分别是：麻省理工学院，白头生物医学研究所和马萨诸塞州大学。

　　Alnylam及Max Planck状告这3机构篡夺原本属于Max Planck的发明专利。目前这一案件在马萨诸塞州Suffolk县高等法庭开庭审理。这一案件的矛盾点在于，Alnylam的创始人， Phil Sharp（1993年诺奖得主，首次证实哺乳动物细胞存在RNAi现象的学者）和David Bartel（研究植物RNAi的学者），两人曾是麻省理工学院的教授，关于RNAi的前期工作是在麻省理工完成的。

　　诉讼各方都拒绝向媒体发表声明，双方争论的焦点在于，被告的3机构关于RNAi沉默基因的方法等申请的专利实际上应该属于Max Planck。而Alnylam是具有Max Planck专利使用权的唯一公司，而一旦这些属于Max Planck的专利被被告3机构获得，那么Alnylam则失去唯一使用权，那么Alnylam就失去在RNAi领域的唯一优势。